Das sichere Löschen von Dateien ist nicht ganz so leicht, wie dies zunächst scheint. Die Bordmittel der meisten Betriebssysteme entfernen die Daten nicht wirklich, es wird lediglich ein Verweis auf den Inhalt entfernt. Mit entsprechenden Programmen ist es ein Leichtes, diese Daten zu rekonstruieren. ArchiCrypt Shredder löscht sensible Daten so, dass eine softwaretechnische Wiederherstellung der Daten unmöglich ist (im Labor des Datenrettungsspezialisten Ontrack unter Beweis gestellt). Die Dateilöschfunktion kann bei Bedarf in das Kontextmenü des Windows Explorers eingebunden werden; Spezialfunktionen wie Löschen des Freispeichers, Bereinigen sogenannter Clustertips (Fragmente am Ende einer Datei, die nicht gelöscht werden können und unter Umständen sensible Informationen enthalten), Überwachen der Onlineverbindung, und das automatische Beseitigen von Internet-Surfspuren sind zentral über die ArchiCrypt Shredder Benutzeroberfläche erreichbar.